著有《辨惑编》、《思贤录》、《龟巢稿》、《怀古录》、《毗陵续志》、《龟巢
文钞》、《龟巢词》等。最能反映他学养与思想倾向的是《武阳志馀》卷十儒林类中记载他的一些轶事。他在苏州一带避难时请求官府黜退吴江三高祠（纪念战国时期越国范蠡、晋代
、唐代
）中的范蠡；而要求修葺三国时东吴名相顾雍的墓莹。在故乡则显扬武进林庄邹忠公浩墓，去掉学官中的土地祠。他主张禁止民间办丧事时做佛事等迷信活动、还向周郎中（正五品官）上书陈述开荒等五件事并向何太守请求减少水脚之征，事事都有利民生民风。

　　
生逢乱世，世衰道丧，以斯文为己任，崇正辟邪。从元至正初年起便隐居于武进白鹤溪（今邹区鹤溪河），构筑小室名叫龟巢。遂自号“龟巢老人”，乡里子弟尊称龟巢先生。常州府曾聘为教授。他对学生循循善诱，总结出一套教学法。浙江行省闻名欲聘为三衢清献书院山长，辞不就。后各地义军起，谢应芳便去苏州一带避难，几次遇危险，一年中搬了五次家，经常揭不开锅。后来苏州人对这位年高德助的饱学之人逐渐有所了解，争聘为子女的老师，他靠束修钱以维生。
　　
削平群雄，建立明王朝后，江南渐渐安定，谢应芳已是70多岁的老人，返回故乡，在武进芳茂山（横山）隐居，勤读写作，老而不倦。当时，朝中高官与在野缙绅们路过常州，必定要去芳茂山上“龟巢”拜访龟巢老人。不管来的人官阶多高、名声多大，谢应芳都平等相待，决不低下阿谀，而且议论必及民生、言谈必论向善。

　　
到了老年，牙齿尽落，常为咀嚼而发愁。有一次，他到寺院拜访一名高僧。高僧知他齿牙不利，特意精心制作了几款豆腐菜肴，既好吃又不需要费力咀嚼。食毕，谢应芳言道：“凡人年老者，以肉养之，古今一致。然老而无齿，则肉林之盛，禁脔之供，其如朵颐何？求其甘软若豆腐者，
谓养老之善物也。”并欣然提笔作《豆腐
》：“谁授淮南玉食方，南山种玉选青黄，工夫磨转天机熟，粗渣囊倾雪汁香。软比牛酥便老齿，甜于蜂蜜润枯肠。当年柱史如知味，饮乳何须窈窕娘。”